Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
THUMPD3Q9BV44 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
THUMPD3Q9BV44 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms