Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms