Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms