Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms