Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms