Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms