Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RETNLBQ9BQ08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms