Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP2Q99959 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms