Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms