Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms