Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNKPQ96T60 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms