Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBL7Q96S82 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms