Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms