Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIC6Q96NY7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC6Q96NY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms