Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms