Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YTHDC1Q96MU7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms