Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms