Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms