Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74BQ96LY2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74BQ96LY2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms