Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX27Q96L92 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms