Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms