Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG3Q96JB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COG3Q96JB2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COG3Q96JB2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms