Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms