Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EAF2Q96CJ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EAF2Q96CJ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms