Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCE1Q969G3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms