Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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