Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DPF3Q92784 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DPF3Q92784 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms