Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms