Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.147e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.89■□□□□ 0.137e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.137e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PPIF-205ENST00000498681 518 ntTSL 215.79■□□□□ 0.127e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PPIF-203ENST00000472580 761 ntTSL 515.79■□□□□ 0.127e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TMCO3-203ENST00000460039 864 ntTSL 315.76■□□□□ 0.117e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-208ENST00000411953 582 ntTSL 515.7■□□□□ 0.17e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.17e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF2-206ENST00000526048 1168 ntTSL 515.6■□□□□ 0.097e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.087e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 MYO7A-210ENST00000605744 2705 ntTSL 215.49■□□□□ 0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 515.46■□□□□ 0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-220ENST00000576420 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.44■□□□□ 0.067e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 HGS-214ENST00000576087 548 ntTSL 415.37■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 315.36■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ELMSAN1-205ENST00000435371 3839 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RARG-216ENST00000551501 555 ntTSL 415.08■□□□□ 07e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 07e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 515.07■□□□□ 07e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 315.01□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ACOT8-207ENST00000484783 1268 ntTSL 215□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.027e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SIAH2-203ENST00000482706 427 ntTSL 314.94□□□□□ -0.027e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-215ENST00000574953 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.9□□□□□ -0.027e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 514.79□□□□□ -0.047e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF2-212ENST00000528802 692 ntTSL 314.78□□□□□ -0.047e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.057e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-214ENST00000574722 586 ntTSL 414.66□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-204ENST00000570638 537 ntTSL 514.66□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 314.63□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CREM-240ENST00000489388 1022 ntTSL 214.62□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 314.57□□□□□ -0.087e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RBCK1-214ENST00000621487 473 ntTSL 214.55□□□□□ -0.087e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.097e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 514.49□□□□□ -0.097e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-214ENST00000435234 1047 ntTSL 314.39□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ACOT8-209ENST00000486165 764 ntTSL 314.38□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.127e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 FRMD4A-207ENST00000492155 2731 ntTSL 214.32□□□□□ -0.127e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NAA60-215ENST00000572739 803 ntTSL 414.23□□□□□ -0.137e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.147e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DYNC1I2-219ENST00000456808 741 ntTSL 414.17□□□□□ -0.147e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 414.14□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 214.14□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PPIF-202ENST00000448165 821 ntTSL 214.13□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ATP11A-215ENST00000495930 564 ntTSL 414.1□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 313.95□□□□□ -0.187e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PHACTR2-209ENST00000451827 675 ntTSL 313.91□□□□□ -0.187e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 513.89□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CMTM7-203ENST00000454304 976 ntTSL 513.86□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PLEKHM3-203ENST00000447645 1915 ntTSL 213.82□□□□□ -0.27e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.27e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.27e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RARG-210ENST00000549859 544 ntTSL 513.64□□□□□ -0.237e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.237e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 MLLT6-201ENST00000611305 483 ntTSL 213.63□□□□□ -0.237e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 213.6□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.247e-9■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 313.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 72.6
DGCR8Q8WYQ5 RARG-218ENST00000552901 523 ntTSL 513.49□□□□□ -0.257e-9■■■■■ 72.6
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 205.4 ms