Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAAF4Q8WXU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAAF4Q8WXU2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms