Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMO7Q8WWI1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms