Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms