Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF397Q8NF99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF397Q8NF99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms