Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAAF3Q8N9W5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAAF3Q8N9W5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms