Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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