Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME8Q8N427 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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