Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC2Q8N158 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC2Q8N158 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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