Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTROBQ8N137 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTROBQ8N137 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTROBQ8N137 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms