Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMYD4Q8IYR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms