Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms