Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC83Q8IWF9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms