Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms