Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMPRSS12Q86WS5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMPRSS12Q86WS5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms