Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3BQ7Z3V4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3BQ7Z3V4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms