Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OTOP1Q7RTM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP1Q7RTM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms