Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q71RC1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q71RC1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q71RC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q71RC1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q71RC1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q71RC1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q71RC1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q71RC1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q71RC1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms