Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP47Q6ZTR5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP47Q6ZTR5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms