Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD2Q6Y1H2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HACD2Q6Y1H2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms