Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC5Q6UXY8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms