Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6Q795 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6Q795 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6Q795 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6Q795 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6Q795 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6Q795 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6Q795 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6Q795 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms